SimVector 4.6.1官方正式版质粒图谱绘制软件

SimVector是一款能够轻松进行质粒图谱绘制的软件。久友下载站小编极力推荐的一款质粒图谱绘制软件SimVector。质粒图谱是生物学研究中常用的图谱类型。当用户需要绘图时，可以借助专业的绘图软件（例如SimVector）来实现。它提供了您所看到的绘图界面，并提供了许多绘图工具供您选择，并且您创建的所有项目都可以在目录结构树下进行分类和管理。 SimVector为您带来了全面的质粒作图解决方案，需要它的朋友可以快速下载它！

使用说明：

质粒图谱

质粒图谱是质粒的图形表示，即限制性酶切位点，例如可识别的较大地标位置的DNA，目的基因，质粒名称和长度

质粒用SimVector绘制质粒图

VectorSimVector是绘制出版物质量质粒图谱的绝佳工具。然后，您可以使用图案，样式，线条和颜色来增强图形。 SimVector为Adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002生成矢量图形格式的质粒图图像。

使用SimVector，您可以将GenBank注释转换为图形特征（线性和圆形序列图）

Plasmad地图样本

质粒的定义

自我一种自我复制的染色体外元件，通常在某些细菌细胞中发现一小段双链DNA。质粒用作将新基因引入细菌的载体，从而使外源“重组” DNA被细胞的蛋白质制造机器识别。

极限分析

限制性酶切分析是基于特定的实验要求，使用适当的酶基和酶过滤标准物来鉴定DNA序列中的限制性酶图谱位点。

限制酶

限制性内切酶是形成细菌防御机制的一部分的细菌酶，其可抵抗外源DNA修饰的限制。他们可以识别特定的寡核苷酸序列，产生双链缺口，并产生独特的DNA分子片段。限制性核酸内切酶由于其可控制的，可预测的，不频繁的和位点特异性的DNA切割，已被证明是在分子水平上解剖，分析和重新配置遗传信息的有用工具。细菌包含400多种此类酶，可识别和切割100多种不同的DNA序列。

限制站点（识别站点）

限制酶切割位点或识别位点是特定限制性酶切割DNA的DNA的特定序列。一些限制位点可能会在DNA中频繁出现，而某些限制位点可能会出现频率更低。

图形SimVector中限制性酶切位点的图形显示

极限图

通过可以切割的各种限制性核酸内切酶的位置来表征双链DNA。

质粒用SimVector绘制质粒图

VectorSimVector是绘制出版物质量质粒图谱的绝佳工具。然后，您可以使用图案，样式，线条和颜色来增强图形。图像可以以Web就绪的图形格式导出以在Web上发布，也可以在Adobe Illustrator 10或Microsoft PowerPoint 2002中作为矢量图形导出。

线性使用SimVector绘制线性或圆形DNA序列图

您可以使用SimVector绘制两个圆圈或线性绘制DNA序列图。它将自动沿着DNA序列图，限制酶位点和att克隆位点排列您的特征。

圆形使用SimVector绘制圆形质粒图

线性使用SimVector绘制线性质粒图

TA克隆功能

TA克隆是由某些类型的DNA聚合酶（例如Taq聚合酶）的末端转移酶活性引起的。该酶在PCR产物的每个末端增加了3'-A突出端。结果，可以将PCR产物直接克隆到线性化的克隆载体中，在每个末端具有单个碱基的3'-T突出端。这样的向量被称为T向量。具有A大检查的PCR产物

ng与该载体以高比例混合。 “ T”载体的互补突出端与PCR产物杂交。结果是重组DNA，这是通过DNA连接酶实现的。

使用SimVector在Silico TA中克隆克隆

VectorSimVector使设计TA克隆实验非常容易。 TA克隆向导接受商业T载体或限制性设计的T载体，将其与修饰的PCR产物结合，并生成高度准确的重组DNA质粒图谱。

技术SimVector实现了其他技术：

Gateway®克隆

使用SimVector，您可以执行Gateway®Cloning的BP和LR反应。 BP反应和生产进入克隆需要供体和表达载体。 LR反应和表达载体的产生需要入口和目的载体。

限制性克隆

该克隆技术需要限制性内切酶来切割载体分子和要克隆的分子。 SimVector可以进行限制酶分析，并允许您在所需序列上过滤，注释和定位限制酶。

限制酶分析

VectorSimVector可以识别DNA序列中的限制酶识别位点，以作图。超过1000种限制酶的综合数据库，用于限制分析。提供了两种酶过滤模式来指定用于限制分析的参数。酶过滤可让您设置酶标准液以满足您的实验要求。为了您的方便，其中包括来自20多家商业提供商的酶组。

绘制准确的质粒图谱

VectorSimVector是绘制出版物质量质粒图谱的绝佳工具。然后，您可以使用图案，样式，线条和颜色来增强图形。 SimVector为Adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002生成矢量图形格式的质粒图图像。

软件特色：

一个可帮助您模拟实验并创建出版物质量图的应用程序

s。

VectorSimVector是绘制出版物和矢量目录质量图以及设计克隆实验的出色工具。

无论您是出售目录质量质粒图谱的公司，还是进行限制性或重组克隆实验的公司，SimVector都将帮助您模拟实验并从头到尾创建出版物质量图谱。

使用SimVector可以绘制各种颜色，图案，字体和线条样式的圆形和线性向量图。

通常，酶名称以两种字体显示，细菌部分以斜体显示。在地图上的任何地方（包括功能注释），在单个文本中使用多种字体样式和颜色。

常见问题：

SimVector软件如何进行限制酶分析？

VectorSimVector使用1000多种限制酶的综合数据库进行限制分析。 SimVector分析并绘制DNA序列。通过指定范围，您可以对整个序列以及片段进行限制酶分析。限制酶分析的结果被定位在圆形或线性载体上，显示了限制酶切割位点的位置。研究人员可以使用SimVector对线性或环形DNA进行单个或多个酶分析。输入序列可以从文件上载，粘贴或从NCBI链接中检索，并且可以基于用户设置的参数进行分析。

如何SimVector代表限制位点？

网络精通网络的SimVector始终仅显示有关任何限制酶的最新信息。它允许用户在DNA序列上定位限制性酶切位点并过滤结果，以在有限的区域内显示独特的切割酶，非切割酶或消化位点。它使研究人员能够定义自定义酶或创建自定义酶集。研究人员可以使用市售的限制酶组或定义常规的限制酶组。可以通过属性过滤，通过手动添加酶或通过添加或删除酶来修改现有集来从任何可用集创建定制酶集。限制酶可以通过其特性（例如识别位点和突出类型）或通过手动选择酶来从酶集中过滤掉。

软件功能：

计划克隆实验：

设计网关克隆实验：使用SimVector，您可以执行构成网关克隆的BP和LR反应。 BP反应和生产进入克隆需要供体载体和表达载体。 LR反应和表达载体的产生需要进入载体和目的载体。

设计TA克隆载体：SimVector使设计TA克隆实验变得容易。 TA克隆向导接受商业T载体或限制性设计的T载体，并将其与修饰的PCR产物结合。然后，您可以生成高精度的重组DNA质粒图。

执行限制性克隆：

该克隆技术需要限制性内切酶来切割载体分子和要克隆的分子。 SimVector可以进行限制酶分析，并允许您在所需序列上过滤，注释和定位限制酶。

进行限制酶分析：

VectorSimVector可以识别DNA序列中的限制酶识别位点，以作图。超过1000种限制酶的综合数据库，用于限制分析。提供了两种酶过滤模式来指定用于限制分析的参数。酶过滤可让您设置酶标准液以满足您的实验要求。为了您的方便，其中包括来自20多家商业提供商的酶组。

绘制目录质量质粒图谱：

绘制质粒图谱：使用SimVector绘制公共质量的质粒图谱。

多克隆站点（MCS）显示：

VectorSimVector通过解释GenBank标头注释（如果可用）来识别MCS，或者您可以手动指定它们。

它甚至可以巧妙地列出仅在MCS内到处裂解的酶。这种特殊格式称为“包围式视图”。

目录质量矢量图形：为Adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002以矢量图形格式生成质粒图谱图像。

导出网络图像：导出JPEG，PNG和TIF格式的高分辨率质粒图谱图像，以便轻松添加到网站并将图像导出到主机页面

图形Entrez函数：将GenBank注释转换为图形函数（线性和圆形序列图）。

创建向量：

在不知道向量顺序的情况下创建向量

自定义矢量地图：

简单的样式-只需单击一下按钮，即可选择数百种字体，颜色，样式和填充样式中的限制性内切酶和功能。

颜色主题-定义您自己的自定义颜色主题并将其反复应用。

对选取的对象进行选框分组以快速设置所有样式。

线性和圆形视图生成圆形和线性向量图。

放大以获取详细图形，或缩小以获取概述。

文本-添加文本以注释质粒图谱。

印刷：

打印-打印矢量图，序列，详细的分析结果以及添加的序列注释。

序列分析：

ORF搜索-您可以在所选阅读框中找到ORF，这些ORF由所选的起始密码子和终止密码子标识，并满足指定的最小长度。现在，只需单击一下，就可以确保克隆后结构仍在框架中。图形化的ORF显示已准备好供参考和进一步分析。

序列翻译-翻译序列以模仿表达的蛋白质并检查可能的阅读框错误。

限制性核酸内切酶分析-通过指定范围，您可以对整个序列和片段进行限制性核酸内切酶分析。限制酶分析的结果被定位在圆形或线性载体上，显示了限制酶切割位点的位置。

限制站点映射-限制站点映射是计划实验的第一步。 SimVector可以完全控制所有限制酶分析的关键参数。使用SimVector可以轻松执行受限站点映射。只需选择要用于分析的酶，然后让SimVector绘制限制性酶的高质量图即可。 SimVector可以在您的图谱中分析1,000多种限制酶和多达24种市售限制酶集。

限制酶过滤-通过突出端，识别位点长度和其他属性选择限制酶。

自定义限制酶-创建自己的酶以进行重复分析。

安装方式：

1.下载并解压缩该软件，双击安装程序以进入SimVector安装向导，然后单击[下一步]。

2.阅读软件许可协议，选中选项[我接受协议]，然后继续进行下一个安装。

3.使用条款，请在继续之前阅读以下重要信息。

4.选择安装位置，用户可以选择默认的C：\ Program Files（x86）\ SimVector 4.6，或者对其进行自定义

5.正在安装SimVector，并且用户等待安装完成。